El proyecto educativo Juan Pablo II fue concebido como un acto de amor para el pueblo de Zarumilla. Fue inspirado como la herramienta clave para que los niños, niñas y jóvenes de la Provincia de Zarumilla y la Región Tumbes construyan su vida sobre la base de una formación académica y con valores que les permita en el futuro ser hombres y mujeres exitosos y que luego sumen esfuerzos para el engrandecimiento de la región y del país.

Durante el año 2004 desarrollamos todo el proceso estratégico en sus tres etapas: Planeamiento, Dirección y Control. El 11 de febrero del año 2005 concluida la elaboración del proyecto solicitamos a la Dirección Regional de Educación la autorización para la apertura y funcionamiento de la Institución Educativa Privada Preuniversitaria “JUAN PABLO II” en los niveles de cuna/jardín, inicial, primaria y secundaria de menores. El 27 de junio del mismo año la Dirección Regional de Educación de Tumbes emite la Resolución Regional Sectorial N° 02288 con la que autoriza la apertura y funcionamiento de la Institución Educativa Privada Preuniversitaria “JUAN PABLO II” en sus tres niveles.

Fue un tema difícil darle el nombre a la Institución Educativa. Teníamos en cartera nombres de científicos, filósofos, literatos de renombre nacional e internacional. La idea fundamental era seleccionar un personaje de trascendencia universal y que su nombre y personalidad establezca rápidamente una relación enfática con la comunidad. El análisis y las encuestas orientaron hacia la toma de decisiones, que en nuestro caso fue el Papa Juan Pablo II (Karol Wojtyla Kaczorowska), por reunir el perfil exacto a la orientación del proyecto.

El 14 de febrero del año 2005 iniciamos la construcción de la infraestructura con un diseño arquitectónico que combino la arquitectura griega antigua por sus columnas tipo jonico y corintio y la arquitectura romana por sus arcos perpianos. La estatua de nuestro patrono JUAN PABLO II, reposa en una construcción inspirada en la arquitectura Renacentista.

El 25 de febrero del año 2006, en tiempo record concluyo la construcción de la infraestructura educativa consistente en:
Dos pabellones de 8 aulas cada una, un moderno auditorio, lozas deportivas, parques infantiles, servicios higiénicos, áreas verdes, entre otras. Todo estaba listo para el inicio del año académico.

El sábado 14 de marzo del año 2006, inauguramos la Institución Educativa. A este acto de trascendental importancia asistieron todas las autoridades de la Provincia, padres de familia y alumnos que para ese entonces teníamos matriculados 330 distribuidos en tres niveles. Los padrinos fueron el Dr. Percy Leon Dios y su Sra. esposa Marcela Yuyes.

El 6 de marzo del año 2006 iniciamos las actividades académicas inspirados en el paradigma educativo: Enfoque centrado en el Aprendizaje. De esta manera se puso en funcionamiento el proyecto que al principio fue un sueño y hoy con gran esfuerzo es una realidad que disfruta el pueblo de Zarumilla.